Voorheen onbekende sarbecovirus aan die lig gebring by vlermuise in die Verenigde Koninkryk

Voorheen onbekende sarbecovirus aan die lig gebring by vlermuise in die Verenigde Koninkryk
Voorheen onbekende sarbecovirus aan die lig gebring by vlermuise in die Verenigde Koninkryk
Anonim

Wetenskaplikes het die nuwe sarbecovirus RhGB01 ontdek nadat hulle slegs 53 fekale monsters van hoefyster-vlermuise ondersoek het en die geografiese en spesie-reeks koronavirusse soos SARS-CoV en SARS-CoV-2 uitgebrei het. Vermoedelik sal hulle in die hele reeks Rhinolophidae voorkom - van Australië en Japan tot Europa en Afrika.

Meer as 'n jaar later is die bron van die huidige koronavirus -uitbraak nog onbekend, ondanks duisende studies, WGO -verslae, ondersoeke en meer. Hoefkoffermuise (Rhinolophus) word beskou as natuurlike gashere vir beide SARS-CoV (ernstige akute respiratoriese sindroom wat in 2002 ontstaan het) en ons SARS-CoV-2, maar geen intermediêre draer wat die virus na mense oorgedra het nie, is geïdentifiseer.

Die reeks vlermuise dek die grootste deel van die ou wêreld, maar die grootste deel van die monsters is voorheen in Oos- en Suidoos-Asië geneem: daar is ongeveer 50 SARS-verwante koronavirusse aangetref in tien vlermuissoorte, waarvan 48 aan nege verskillende hoefyster vlermuise. Filogenetiese ontleding van die nuwe sarbecovirusse-dit wil sê koronavirusse wat verband hou met SARS-hoefijzervormig in China het getoon dat dit die naaste verwant is aan SARS-CoV en SARS-CoV-2.

Wetenskaplikes van die Universiteit van East Anglia het besluit om hierdie data aan te vul. Die skrywers van die studie, wat gister in Scientific Reports gepubliseer is, het in Augustus en September 2020 ontlasting van tientalle klein hoefystervormige diere in Somerset, Monmouthshire en Wallis versamel. Die diere is gevang met valstrikke of nette wat naby hokke en in woude geplaas is.

Ontlasting is in individuele steriele buise met RNAlater -oplossing vir RNA -stabilisering geplaas, afgekoel en gevries gestoor voor analise. Die wetenskaplikes het toe genoomvolgorde uitgevoer, wat 'n voorheen onbekende virus in een van 53 monsters geïdentifiseer het. Dit is RhGB01 genoem. Die virus bevat 10 koderende gene, terwyl SARS-CoV en SARS-CoV-2-11 koderende gene met die insluiting van die ORF8-proteïen.

'Filogenese van die spike-proteïen- en nukleotiedvolgorde het getoon dat RhGB01 gekombineer word in 'n monofiletiese klade met BM48-31 / BGR / 2008, die Blasius hoefyster-sarbekovirus (Rhinolophus blasii), wat in 2008 in Bulgarye ontdek is. RhGB01 verskil van die groepe wat die patogene menslike beta-koronavirus SARS-CoV en SARS-CoV-2 bevat, maar korreleer nouer met die koronavirus wat verband hou met ernstige akute respiratoriese sindroom, 'skryf die wetenskaplikes.

Die belangrikste reseptor vir die penetrasie van SARS-CoV en SARS-CoV-2 in die liggaam bly die ACE2-ensiem; hierdie geleentheid word daardeur gebied deur die reseptorbindende motief (RBM) binne die reseptorbindende domein (RBD) van die S -proteïen - dit vorm die omhulsel van die virus. Die nuwe RhGB01 deel onderskeidelik 68% en 67% aminosuuridentiteit met RBD SARS-CoV en SARS-CoV-2, maar slegs 43% en 48% soortgelyk aan hulle in RBM. Ter vergelyking: die naaste virusse wat verband hou met SARS-CoV-2, vlermuise en pangoliene het 89% en 86% toeval met RBD SARS-CoV-2 en 75, 77% met SARS-CoV. Boonop toon RhGB01 min RBM -ooreenkoms met die Midde -Ooste -respiratoriese sindroomvirus (MERS). Dit het egter nie 'n bykomende furin-splitsingsplek by die aansluiting van S1- en S2-proteïene nie, wat spesifiek is vir SARS-CoV-2.

'Die lae ooreenkoms, gebrek aan kontakreste en strukturele verskille in vergelyking met die reseptorbindende domein van SARS-CoV en SARS-CoV-2, dui waarskynlik op die gebrek aan vermoë om aan ACE2 te bind. Daarom is dit onwaarskynlik dat RhGB01 soönoties sal wees as dit nie gemuteer word nie. Maar in vitro -toetse is nodig om die gebrek aan binding aan ACE2 of ander reseptore in menslike selle eksperimenteel te bevestig en om die vermoë om aan ander ACE2 -reseptore van soogdiere te bind, vas te stel, 'het die skrywers opgemerk.

Alhoewel dit blyk dat RhGB01 al duisende jare bestaan, meen wetenskaplikes dat dit die moeite werd is om die toesig oor koronavirus by hoefystervlermuise, sowel as ander vlermuissoorte, te versterk. Immers, beide SARS-CoV en SARS-CoV-2 het vermoedelik ontwikkel as gevolg van mutasie, homoloë rekombinasie (uitruil van nukleotiedvolgordes tussen twee soortgelyke of identiese chromosome) en "deurloop" deur ten minste een intermediêre gasheer.

Dit wil sê, die virus-voorganger van die natuurlike gasheer het genetiese aanpassing ontvang, wat dit moontlik gemaak het om mense suksesvol te besmet en tussen ons oor te dra. En as daar 'n moontlikheid bestaan van homoloë rekombinasie van sarbecovirusse deur middel van infeksie, is daar 'n risiko vir nuwe zoönoses.

'Elke vlermuis wat 'n SARS-agtige virus dra, kan 'n ketel word vir mutasies. En as 'n vlermuis met RhGB01 besmet raak met SARS-CoV-2, is daar 'n risiko dat hierdie virusse hibriedeer-en 'n nuwe een verskyn wat mense reeds kan besmet, 'het die navorsers afgesluit.

Aanbeveel: